首先，二次供水的危害是个伪命题或者说是说法不恰当，应该是说二次供水管理不当或者不合格的二次供水设备的危害大。
城市高层建筑发展速度迅速，楼层高度已经远远超过市政供水所能达到的高度，并且市政供水能力在一定时间内是固定的，这就会造成管网压力不足，水厂没有足够的压力和储力将水输送到每个地方。因此，对于城镇来说，二次供水是必须而不可缺少的。至于危害或多或少，其带来的利远大于弊端，并且弊端是可以通过人为手段大大减少的。给二次供水带来危害的主要因素和降低危害的手段如下：
1、二次供水设备。二次供水设备的危害主要是二次供水设备的水泵和管道材质不合规造成的，最常见的就是采用铸铁材质的泵和普通钢管。内部容易生锈和藏污纳垢，给水源造成了严重的二次污染。一般降低污染和危害的措施是采用清洁卫生的不锈钢泵作为增压泵，供水设备的管道和阀门采用卫生级304不锈钢材质可大幅度降低二次供水带来的危害。再者就是二次供水设备的形式也会对污染有影响，比如传统的箱式变频恒压供水设备带来的污染危害就要大于罐式无负压供水设备，因为箱式变频供水设备需要大面积蓄水，而罐式无负压供水设备则不需要大量蓄水，减少了蓄水环节的污染。
2、蓄水箱。蓄水环节带来的污染可以说是二次供水污染重最大的污染，一般造成蓄水环节危害的主要因素有材质本身污染，材质包括用土建水池和不合格的不锈钢板材焊接水箱造成的，其他由于水箱不够密封各种灰尘杂质、昆虫、老鼠和蟑螂等也会造成污染。解决方法是采用合格卫生不锈钢板焊接成密闭水箱，然后定期清洗和消毒可大大降低危害。
3、输水管道和水龙头。输水管道同样会造成严重污染，典型的是采用普通钢管输水会造成严重锈蚀，龙头含铅量超标等都会带来严重的污染和危害。解决方法是有条件的场合采用卫生级不锈钢管输水，采用各项规格达标的龙头即可大幅降低危害。
4、来自自来水本身的污染。自来水本身也并不纯净，包括余氯和自来水输送管道中的污物污染，从而造成在水箱发酵产生不洁净的因素都会污染水源。自来水的余氯一般是没办法或者没那个条件处理的，解决自来水在输送环节的污染一般方法是在进水箱的前端加过滤器和紫外线消毒装置可降低污染和危害。
城市要发展，人们要生活，二次供水是必不可少的。虽然管理不当的二次供水会造成严重污染给健康带来危害，但是这些危害都是可以人为减少到最低程度的。